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1、光路不同：原子吸收光源、原子化器和檢測器在一條光路上；原子熒光為垂直光路。
2、原理不同：原子吸收利用原子的特征吸收光譜；原子熒光則利用原子的激發(fā)-躍遷光譜（熒光）。
3、靈敏度不同：對于原子吸收，增加光源強度同時(shí)會(huì )增加背景吸收，而原子熒光信號強度與激發(fā)光源強度成正比，故靈敏度可以極大提高。
原子熒光是原子蒸汽受具有特征波長(cháng)的光源照射后，其中一些自由原子被激發(fā)躍遷到較高能態(tài)，然后去活化回到某一較低能態(tài)（常常是基態(tài)）而發(fā)射出特征光譜的物理現象。當激發(fā)輻射的波長(cháng)與產(chǎn)生的熒光波長(cháng)相同時(shí)，稱(chēng)為共振熒光，它是原子熒光分析中zui主要的分析線(xiàn)。另外還有直線(xiàn)躍遷熒光，階躍線(xiàn)熒光，敏化熒光，階躍激發(fā)熒光等，各種元素都有其特定的原子熒光光譜，根據原子熒光強度的高低可測得試樣中待測元素含量。這就是原子熒光光譜分析。
